Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20854Q62461 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20854Q62461 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20854Q62461 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20854Q62461 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20854Q62461 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20854Q62461 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20854Q62461 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20854Q62461 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20854Q62461 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20854Q62461 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20854Q62461 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20854Q62461 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20854Q62461 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20854Q62461 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20854Q62461 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20854Q62461 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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