Protein–RNA interactions for Protein: Q62432

Smad2, Mothers against decapentaplegic homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad2Q62432 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad2Q62432 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad2Q62432 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad2Q62432 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad2Q62432 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad2Q62432 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad2Q62432 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad2Q62432 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad2Q62432 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smad2Q62432 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad2Q62432 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad2Q62432 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms