Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl12Q62401 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl12Q62401 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms