Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tff3Q62395 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms