Protein–RNA interactions for Protein: Q62230

Siglec1, Sialoadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siglec1Q62230 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Siglec1Q62230 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Siglec1Q62230 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Siglec1Q62230 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms