Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scn9aQ62205 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scn9aQ62205 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scn9aQ62205 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scn9aQ62205 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms