Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Trim27Q62158 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim27Q62158 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms