Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mrc1Q61830 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Mrc1Q61830 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mrc1Q61830 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms