Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn1Q61809 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn1Q61809 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms