Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gli3Q61602 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Gli3Q61602 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gli3Q61602 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gli3Q61602 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms