Protein–RNA interactions for Protein: Q61205

Pafah1b3, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b3Q61205 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pafah1b3Q61205 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pafah1b3Q61205 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pafah1b3Q61205 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pafah1b3Q61205 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms