Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik1Q60934 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms