Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Neurod1Q60867 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Neurod1Q60867 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Neurod1Q60867 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms