Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkn2dQ60773 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdkn2dQ60773 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkn2dQ60773 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms