Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdkn2cQ60772 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkn2cQ60772 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms