Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atf3Q60765 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Atf3Q60765 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms