Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Epha1Q60750 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Epha1Q60750 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Epha1Q60750 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Epha1Q60750 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epha1Q60750 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Epha1Q60750 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms