Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samhd1Q60710 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Samhd1Q60710 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samhd1Q60710 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms