Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rnf123Q5XPI3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf123Q5XPI3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf123Q5XPI3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms