Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp13a3Q5XF89 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp13a3Q5XF89 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a3Q5XF89 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms