Protein–RNA interactions for Protein: Q5UKY4

Cd200r3, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r3Q5UKY4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200r3Q5UKY4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200r3Q5UKY4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200r3Q5UKY4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200r3Q5UKY4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200r3Q5UKY4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200r3Q5UKY4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200r3Q5UKY4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200r3Q5UKY4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd200r3Q5UKY4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd200r3Q5UKY4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd200r3Q5UKY4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd200r3Q5UKY4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms