Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NotoQ5TIS6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NotoQ5TIS6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms