Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brip1Q5SXJ3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Brip1Q5SXJ3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brip1Q5SXJ3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brip1Q5SXJ3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brip1Q5SXJ3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brip1Q5SXJ3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.9 ms