Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsr1Q5SWD9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsr1Q5SWD9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsr1Q5SWD9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.3 ms