Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam46cQ5SSF7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms