Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf215Q5SPX3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf215Q5SPX3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf215Q5SPX3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf215Q5SPX3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf215Q5SPX3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf215Q5SPX3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf215Q5SPX3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf215Q5SPX3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf215Q5SPX3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms