Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PkdccQ5RJI4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PkdccQ5RJI4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms