Protein–RNA interactions for Protein: Q5ISE2

Zfp36l3, mRNA decay activator protein ZFP36L3, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l3Q5ISE2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp36l3Q5ISE2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp36l3Q5ISE2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp36l3Q5ISE2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp36l3Q5ISE2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp36l3Q5ISE2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp36l3Q5ISE2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp36l3Q5ISE2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp36l3Q5ISE2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp36l3Q5ISE2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp36l3Q5ISE2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms