Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hs3st6Q5GFD5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms