Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ecm2Q5FW85 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms