Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms