Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spire1Q52KF3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spire1Q52KF3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms