Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C1qtnf9Q4ZJN1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C1qtnf9Q4ZJN1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms