Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc84Q4VA36 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms