Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmub2Q3V209 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmub2Q3V209 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms