Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnah12Q3V0Q1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnah12Q3V0Q1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms