Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bbof1Q3V079 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Bbof1Q3V079 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms