Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Chpf2Q3UU43 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Chpf2Q3UU43 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms