Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B230104I21RikQ3USW4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
B230104I21RikQ3USW4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B230104I21RikQ3USW4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms