Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Skap2Q3UND0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms