Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mccc2Q3ULD5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mccc2Q3ULD5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc2Q3ULD5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc2Q3ULD5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms