Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Puf60Q3UEB3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Puf60Q3UEB3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Puf60Q3UEB3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Puf60Q3UEB3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Puf60Q3UEB3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Puf60Q3UEB3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Puf60Q3UEB3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Puf60Q3UEB3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Puf60Q3UEB3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Puf60Q3UEB3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Puf60Q3UEB3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms