Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Yipf3Q3UDR8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Yipf3Q3UDR8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms