Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf166Q3U9F6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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