Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtpbp6Q3U6U5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtpbp6Q3U6U5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms