Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hvcn1Q3U2S8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms