Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
InipQ3TXT3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
InipQ3TXT3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
InipQ3TXT3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
InipQ3TXT3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
InipQ3TXT3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms