Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trmt1Q3TX08 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trmt1Q3TX08 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt1Q3TX08 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms