Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTL0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3TTL0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTL0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3TTL0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTL0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3TTL0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTL0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTL0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTL0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTL0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3TTL0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms