Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
D17Wsu92eQ3TT38 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D17Wsu92eQ3TT38 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
D17Wsu92eQ3TT38 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms